La toma de muestra es uno de los procedimientos que utilizan las instituciones de control de alimentos con el fin de probar que los mismos cumplen las especificaciones en materia reglamentaria. Tomar muestras es fundamentalmente una tarea de prevención que, dada la gran cantidad de productos existente en el mercado, obliga a definir criterios para seleccionar productos cuando se aplica este procedimiento. Este estudio revela las conclusiones a partir de los resultados obtenidos por una institución de control de alimentos durante el periodo 2005-2012. Esta investigación revela que el 46,6% de las 4.178 muestras de alimentos analizadas en el periodo tuvieron un resultado no apto.Las tomas de muestra, cuando son referidas a tipos de comercio situados en eslabones de la cadena agroalimentaria, se focalizaron en los que cuentan con infraestructura más desarrollada para elaborar o comercializar, según el eslabón en consideración, un único lote de producto en mayor cantidad. También propone una metodología para organizar los datos sobre muestras de alimentos en laboratorios. Los fines son mejorar la calidad de las toma de muestra y facilitar que la información de resultados de análisis de muestras, que está en laboratorios que operan en distintas localidades del país, sea comparable sobre la base del Código Alimentario Argentino.