Esta tesis presenta parte de la experiencia recogida a lo largo de 10 años en la implementación un Programa de Monitoreo de la Biodiversidad a largo plazo (en adelante PMB), que cubre unas 500.000 has de bosque amazónico en la provincia de Cuzco, Perú, y que se implementa con el fin de monitorear los efectos sobre la diversidad biológica del Proyecto Camisea (PC), uno de los desarrollos gasíferos más importantes de América Latina.La tesis analiza los principales conflictos y dificultades que debieron ser sorteados, así como los logros que se obtuvieron a lo largo en la implementación y el sostenimiento del PMB, destacando aquellos aspectos que debieron cambiarse e incorporarse a la formación del especialista para consolidar la formación como proyectista. Entre los principales desafíos que se presentaron, se debieron incorporar a la gestión del PMB ejes de acción que trascienden el ámbito de la investigación científica, y que fueron inicialmente subestimados. El PMB fue creado para determinar impactos en la biodiversidad y generar recomendaciones que permitieran a la empresa operadora implementar medidas de manejo para la conservación en el área del Proyecto. Esta tarea implicó la adquisición de habilidades comunicacionales, de manejo de los recursos humanos y de planificación estratégica a lo largo del Proyecto, que definieron un camino de crecimiento y un cambio en el rol ocupacional. Esta tesis analiza los nodos de conflicto más importantes que implicaron la conducción del PMB y los aspectos estratégicos vinculados a la gestión del PMB, por constituir los aspectos centrales en la evolución del Proyecto ambiental que como experiencia puede capitalizarse en el desarrollo de proyectos similares.